Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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HIF1AQ16665 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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HIF1AQ16665 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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