Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms