Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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