Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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