Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.2 ms