Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PTPN13Q12923 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PTPN13Q12923 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PTPN13Q12923 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PTPN13Q12923 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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