Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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