Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms