Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms