Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXM1Q08050 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXM1Q08050 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms