Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms