Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms