Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms