Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms