Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms