Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM193AP78312 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM193AP78312 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms