Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms