Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLE2P56282 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLE2P56282 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms