Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTPAP49638 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms