Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms