Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP5P45974 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP5P45974 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP5P45974 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP5P45974 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP5P45974 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP5P45974 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP5P45974 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP5P45974 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP5P45974 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP5P45974 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP5P45974 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP5P45974 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP5P45974 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP5P45974 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP5P45974 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP5P45974 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP5P45974 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP5P45974 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP5P45974 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP5P45974 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP5P45974 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP5P45974 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms