Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A3P40879 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A3P40879 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A3P40879 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A3P40879 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A3P40879 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A3P40879 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A3P40879 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A3P40879 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A3P40879 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A3P40879 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A3P40879 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A3P40879 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A3P40879 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A3P40879 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms