Protein–RNA interactions for Protein: P37023

ACVRL1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVRL1P37023 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACVRL1P37023 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms