Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms