Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP1P29466 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP1P29466 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP1P29466 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP1P29466 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP1P29466 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms