Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms