Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSSP25774 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms