Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XPAP23025 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XPAP23025 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XPAP23025 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XPAP23025 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XPAP23025 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XPAP23025 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
XPAP23025 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
XPAP23025 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XPAP23025 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms