Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NTF3P20783 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NTF3P20783 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms