Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LIG1P18858 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIG1P18858 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIG1P18858 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIG1P18858 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIG1P18858 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIG1P18858 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIG1P18858 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIG1P18858 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIG1P18858 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIG1P18858 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIG1P18858 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIG1P18858 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIG1P18858 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms