Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AC007228.2-201ENST00000602145 1328 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 C9orf85-203ENST00000377031 1107 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC003075.1-208ENST00000415246 596 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms