Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BMP3P12645 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BMP3P12645 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BMP3P12645 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BMP3P12645 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BMP3P12645 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMP3P12645 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms