Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PCNAP12004 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PCNAP12004 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PCNAP12004 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNAP12004 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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