Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DMDP11532 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DMDP11532 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DMDP11532 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DMDP11532 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DMDP11532 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DMDP11532 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DMDP11532 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DMDP11532 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DMDP11532 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DMDP11532 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DMDP11532 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DMDP11532 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DMDP11532 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DMDP11532 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DMDP11532 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DMDP11532 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DMDP11532 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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