Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms