Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOP08100 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOP08100 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOP08100 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOP08100 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOP08100 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOP08100 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOP08100 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOP08100 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms