Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRM2P04554 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRM2P04554 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRM2P04554 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRM2P04554 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRM2P04554 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRM2P04554 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRM2P04554 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRM2P04554 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRM2P04554 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRM2P04554 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRM2P04554 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRM2P04554 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRM2P04554 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRM2P04554 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRM2P04554 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRM2P04554 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRM2P04554 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRM2P04554 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms