Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPBO95292 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPBO95292 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPBO95292 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPBO95292 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPBO95292 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms