Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SCN2BO60939 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SCN2BO60939 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SCN2BO60939 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SCN2BO60939 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SCN2BO60939 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SCN2BO60939 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SCN2BO60939 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SCN2BO60939 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SCN2BO60939 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SCN2BO60939 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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