Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAK2O60296 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAK2O60296 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms