Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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BCKDKO14874 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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BCKDKO14874 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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BCKDKO14874 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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BCKDKO14874 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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BCKDKO14874 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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BCKDKO14874 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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BCKDKO14874 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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BCKDKO14874 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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BCKDKO14874 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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