Protein–RNA interactions for Protein: O00264

PGRMC1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC1O00264 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1O00264 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms