Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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