Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms