Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PIP5K1A-203ENST00000368890 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ITIH5-209ENST00000613909 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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