Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME2A4GXA9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EME2A4GXA9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms