Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms