Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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