Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USP36Q9P275 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP36Q9P275 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USP36Q9P275 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP36Q9P275 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
USP36Q9P275 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP36Q9P275 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP36Q9P275 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP36Q9P275 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USP36Q9P275 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms