Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms